User guide

iScan System User Guide 31
Chapter 4
Configuring iScan Control
Software
Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Omitting BeadChips from a Scan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
Preventing Sections of a BeadChip from being Scanned . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
Changing Scan Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Generating Normalized Data and Genotype Calls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Specifying Input and Output Paths . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Verifying DMAP File Integrity . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40