User guide

vi IB0054606-02 A
OFED+ Host Software Release 1.5.4
User Guide
Debugging MPI Programs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-22
MPI Errors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-22
Using Debuggers. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-22
5 Using Other MPIs
Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-1
Installed Layout . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-2
Open MPI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-3
MVAPICH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-3
Compiling MVAPICH Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-3
Running MVAPICH Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-3
Further Information on MVAPICH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-4
MVAPICH2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-4
Compiling MVAPICH2 Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-4
Running MVAPICH2 Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-5
Further Information on MVAPICH2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-5
Managing MVAPICH, and MVAPICH2
with the mpi-selector Utility . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-5
Platform MPI 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-6
Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-6
Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-6
Compiling Platform MPI 8 Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-7
Running Platform MPI 8 Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-7
More Information on Platform MPI 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-7
Intel MPI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-7
Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-8
Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-8
Compiling Intel MPI Applications. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-10
Running Intel MPI Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-10
Further Information on Intel MPI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-11
Improving Performance of Other MPIs Over IB Verbs . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-12
6 SHMEM Description and Configuration
Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6-1
Interoperability . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6-1
Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6-1
SHMEM Programs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6-3
Basic SHMEM Program. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6-3
Compiling SHMEM Programs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6-4