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vi | ChemiDoc MP Imaging System with Image Lab Software
Table of Contents
Chapter 6 Analyzing Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
Image Types . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
Using Auto Analysis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
Analysis Tool Box Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Image Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136
Correcting a Slanted Gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137
Cropping a Gel Image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137
Inverting Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
Merging Images. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
Lane and Bands Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139
Detecting Lanes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140
Using the All Lanes and Single Lane Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140
Copying Lanes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144
Detecting Bands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144
Editing the Detected Bands. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Normalizing Volume Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149
Using the Normalization Tool . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150
Optimizing Normalization of Volume Data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151
Detect the Lanes in the Channels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152
Make Adjustments to the Lanes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152
Detect the Bands. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154
Subtract any Extraneous Background . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155
Remove Compromised Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155
View the Data in the Analysis Table. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156
Adding a Channel to a Single Image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157
Molecular Weight (MW) Analysis Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 160
Quantity Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166
Annotation Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172
Add Annotations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173
Alignment. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173
Text Properties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
Color . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
Rotate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
Volume Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175