User guide

User Guide | v
Table of Contents
Step 2. Detect Lanes and Bands. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
Step 3. Analyze Molecular Weight. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
Step 4. Specify Output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
Review Protocol Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92
Creating a Multichannel Image from Single Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
Editing a Saved Protocol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
Positioning the Gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96
Running a Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
Running Signal Accumulation Mode (SAM) Protocols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
Saving Signal Accumulation Mode (SAM) Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99
Setting Up a Custom Application . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Regression Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
Application Tables. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
Chapter 5 Viewing Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
Displaying Gel Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Display Gel Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Zoom Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
Fit in Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
Image Transform . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
Image Colors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
3-D Projection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Image Info . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
Displaying Multichannel Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
Multichannel View . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117
Splitting Multichannel Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118
Displaying Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
Analysis Table Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
Lane and Band Table Measurement Definitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125
Volume Measurement Definitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125
Lane Profile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
Standard Curve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130
Report . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131