LSF Version 7.3 - Administering Platform LSF

Contents
8 Administering Platform LSF
24 Advance Reservation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 421
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 421
Understanding Advance Reservations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 422
Configure Advance Reservation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 424
Using Advance Reservation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 426
25 Dispatch and Run Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 445
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 445
Dispatch and Run Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 445
Run Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 445
Dispatch Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 446
26 Job Dependencies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 449
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 449
Job Dependency Scheduling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 449
Dependency Conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 450
27 Job Priorities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 455
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 455
User-Assigned Job Priority . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 455
Automatic Job Priority Escalation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 457
Absolute Job Priority Scheduling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 457
28 Job Requeue and Job Rerun . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 467
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 467
About Job Requeue . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 468
Automatic Job Requeue . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 469
Job-level automatic requeue . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 471
Reverse Requeue . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 472
Exclusive Job Requeue . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 473
User-Specified Job Requeue . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 474
Automatic Job Rerun . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 475
29 Job Checkpoint, Restart, and Migration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 477
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 477
Checkpoint and restart options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 478
Checkpoint directory and files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 478
Checkpoint and restart executables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 480
Job restart . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 480
Job migration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 481
30 Chunk Job Dispatch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 483
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 483
About Job Chunking . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 483
Configure Chunk Job Dispatch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 484
Submitting and Controlling Chunk Jobs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 486
31 Job Arrays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 489
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 489
Create a Job Array . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 489
Handling Input and Output Files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 491
Redirecting Standard Input and Output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 491