LSF Version 7.3 - Administering Platform LSF

Administering Platform LSF 3
Contents
1 About Platform LSF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
Learn about Platform LSF . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Cluster Concepts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Job Life Cycle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
Part I: Managing Your Cluster
2 How the System Works . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Job Submission . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Job Scheduling and Dispatch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
Host Selection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Job Execution Environment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Fault Tolerance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
3 Working with Your Cluster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Viewing cluster information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
Example directory structures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
Cluster administrators . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Controlling daemons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Controlling mbatchd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
Customize batch command messages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
Reconfiguring your cluster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
4 Working with Hosts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
Host status . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
How LIM Determines Host Models and Types . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
Viewing Host Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Controlling Hosts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Adding a Host . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Remove a Host . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
Adding Hosts Dynamically . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
Add Host Types and Host Models to lsf.shared . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Registering Service Ports . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Host Naming . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86