LSF Version 7.3 - Administering Platform LSF

Administering Platform LSF 11
Contents
Part VII: Monitoring Your Cluster
42 Achieving Performance and Scalability . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 613
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 613
Optimizing Performance in Large Sites . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 613
Tuning UNIX for Large Clusters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 614
Tuning LSF for Large Clusters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 615
Monitoring Performance Metrics in Real Time . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 623
43 Reporting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 627
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 627
Introduction to Reporting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 627
Getting Started with Standard Reports . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 628
Custom Reports . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 630
System Description . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 634
Reports Administration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 636
Test the Reporting Feature . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 648
Disable the Reporting Feature . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 650
Move to a Production Database . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 650
44 Event Generation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 655
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 655
Event Generation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 655
Enabling event generation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 655
Events list . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 656
Arguments passed to the LSF event program . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 656
45 Tuning the Cluster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 659
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 659
Tuning LIM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 660
Improving performance of mbatchd query requests on UNIX . . . . . . . . . . . . . . 667
46 Authentication and Authorization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 673
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 673
Authentication options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 673
Authorization options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 675
47 Job Email and Job File Spooling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 681
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 681
Mail Notification When a Job Starts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 681
File Spooling for Job Input, Output, and Command Files . . . . . . . . . . . . . . . . . . 684
Specifying a job command file (bsub -Zs) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 685
About the job spooling directory (JOB_SPOOL_DIR) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 685
Modifying the job input file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 686
Modifying the job command file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 686
For more information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 686