LSF Version 7.3 - Administering Platform LSF

Contents
10 Administering Platform LSF
35 Load Thresholds . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 553
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 553
Automatic Job Suspension . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 553
Suspending Conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 554
36 Pre-Execution and Post-Execution Commands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 559
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 559
About Pre-Execution and Post-Execution Commands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 560
Configuring Pre- and Post-Execution Commands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 562
37 Job Starters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 567
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 567
About Job Starters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 567
Command-Level Job Starters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 568
Queue-Level Job Starters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 570
Controlling Execution Environment Using Job Starters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 571
38 External Job Submission and Execution Controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 573
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 573
Understanding External Executables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 573
Using esub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 574
Existing esub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 582
Working with eexec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 582
39 Configuring Job Controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 583
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 583
Default Job Control Actions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 583
Configuring Job Control Actions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 585
Customizing Cross-Platform Signal Conversion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 588
Part VI: Interactive Jobs
40 Interactive Jobs with bsub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 591
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 591
About Interactive Jobs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 591
Submitting Interactive Jobs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 592
Performance Tuning for Interactive Batch Jobs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 594
Interactive Batch Job Messaging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 597
Running X Applications with bsub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 598
Writing Job Scripts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 598
Registering utmp File Entries for Interactive Batch Jobs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 601
41 Running Interactive and Remote Tasks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 603
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 603
Running Remote Tasks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 603
Interactive Tasks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 606
Load Sharing Interactive Sessions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 608
Load Sharing X Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 608