HP-MPI User's Guide (11th Edition)

Contents

Preface

Platforms supported. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xvii

Notational conventions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xxi

Documentation resources . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xxii

Credits . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xxiii

1. Introduction

The message passing model. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3

MPI concepts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4

Point-to-point communication . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6

Collective operations. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10

MPI datatypes and packing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14

Multilevel parallelism . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

Advanced topics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

2. Getting started

Getting started using HP-UX or Linux. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20

Configuring your environment. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20

Compiling and running your first application . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22

Directory structure for HP-UX and Linux. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

HP-UX and Linux man pages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25

Licensing Policy for Linux . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26

Version identification . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29

Getting started using Windows. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30

Configuring your environment. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30

Compiling and running your first application . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30

Building and running on a single host . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31

Building and running multihost on Windows CCS clusters. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32

Building and running MPMD applications on Windows CCS . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33

Building an MPI application on Windows with Visual Studio and using the property

pages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35

Building and running on a Windows 2003/XP cluster using appfiles . . . . . . . . . . . . 36

Directory structure for Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37

Windows man pages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38

Licensing Policy for Windows. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39

3. Understanding HP-MPI

Compilation wrapper script utilities. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45