User manual

iii
12 Overview of ESS features for the S family
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
12.1 ESS[S]–Editing files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
12.2 iESS[S]–Inferior ESS processes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
12.3 ESS-help–assistance with viewing help. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
12.4 Philosophies for using ESS[S]. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
12.5 Scenarios for use (possibilities–based on actual usage) . . . . . . . . 64
12.6 Customization Examples and Solutions to Problems . . . . . . . . . . 67
13 ESS for SAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
13.1 ESS[SAS]–Design philosophy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
13.2 ESS[SAS]–Editing files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
13.3 ESS[SAS]–TAB key . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
13.4 ESS[SAS]–Batch SAS processes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
13.5 ESS[SAS]–Function keys for batch processing . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
13.6 iESS[SAS]–Interactive SAS processes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
13.7 iESS[SAS]–Common problems. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
13.8 ESS[SAS]–Graphics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76
13.9 ESS[SAS]–Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76
14 ESS for BUGS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
14.1 ESS[BUGS]–Model files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
14.2 ESS[BUGS]–Command files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
14.3 ESS[BUGS]–Log files. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
15 ESS for JAGS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
15.1 ESS[JAGS]–Model files. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
15.2 ESS[JAGS]–Command files. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
15.3 ESS[JAGS]–Log files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
16 Bugs and Bug Reporting, Mailing Lists . . . . 80
16.1 Bugs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
16.2 Reporting Bugs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
16.3 Mailing Lists. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
16.4 Help with emacs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
Appendix A Customizing ESS . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
Indices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Key index. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Function and program index. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Variable index . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
Concept Index . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85