Manual

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Cipher DGGE Instructions 2/28/14
TABLE OF CONTENTS
Important User Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3-4
Section 1: General Information
1.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.2 Specications
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.3 Safety
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
Section 2: DGGEK Unit Set-Up
2.1 Unpacking Instructions
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6-7
2.2 Filling DGGEK Tank with Buffer
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
2.3 Heater/Stirrer/By-Pass Pump (Controller) Instructions
. . . . . . . . . . 8-13
2.4 Setting Buffer Temperature
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
2.5 Connecting Power Supply
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14-15
Section 3: Gel Casting Options
3.1 Preparation of Glass Plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
3.2 Gel Casting Techniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .16-20
3.3 Vertical Gradient Formation
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
3.4 Perpendicular Gel Casting
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22-23
Section 4: Gel Running Preparations
4.1 Preparation of Cassettes
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
4.2 Buffer Cycling Set-Up . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25-26
Section 5: Running Conditions
5.1 Running the Gels
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
5.2 Removing the Gels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
5.3 Buffer Disposal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Section 6: Recommended Buffers
6.1 Stock Solutions
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
Section 7: Comb Specications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Section 8: References
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
Section 9: Troubleshooting
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Section 10: Maintenance of Equipment
10.1 Care and Handling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
10.2 Maintenance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Section 11: Ordering Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
Section 12: Regulatory Compliance
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34-35